Yapı denetim sistemi, inşaatların proje ve mevzuata uygun şekilde yapılmasını bağımsız bir denetim kuruluşu aracılığıyla güvence altına almayı amaçlar. Yapı sahibi, ruhsat öncesinde bir yapı denetim kuruluşuyla sözleşme imzalamak zorundadır.
Denetim kuruluşu; temel, kalıp, demir, beton dökümü gibi kritik aşamalarda sahada bulunarak uygunluğu kontrol eder ve bulguları resmî tutanaklarla kayıt altına alır. Aykırılık tespit edilirse ilgili idareye bildirim yapılır.
Hizmet bedeli, yapının yaklaşık maliyeti üzerinden hesaplanır ve inşaat ilerledikçe aşamalı olarak ödenir; bir kısmı devlet payı olarak ayrılır.